---- 医院由院本部、香蜜湖分院和二门诊部三部份组成。院本部设有门诊和住院部。住院部有内科一区（内分泌、呼吸、肾内、中医）、内科二区（神经内科、消化内科、血液肿瘤）、内科三区（综合病区）、内科四区（心血管）、外科一区（神经外科、泌尿外科）、外科二区（普通外科、心胸外科）、外科三区（骨一、骨二）、外科四区（肛肠科）、妇产科、儿科、新生儿科、中医科、耳鼻咽喉科、眼科。 医院设有宾馆式住院部，设置400张病床。各病房设有电视、空调、卫生间，中心供氧，高级病房配备了冰箱、电话、沙发。开设了心肾实验室、基因实验室、内分泌实验室等临床科研基地。
---- 门诊部设急诊、内、外、妇、儿、中医、口腔、眼、耳鼻咽喉、针灸理疗、美容、皮肤等科室，内科门诊分设心血管、内分泌、肾脏病、消化病、神经疾病、呼吸疾病、风湿病、血液病、肿瘤等专科，外科门诊设心胸、腹部、肝胆、泌尿、骨科、肛肠科、男性学、不孕症、疼痛等专科，大部分由高级专家应诊，日门诊量近2000余人次。并设有血液净化中心、碎石中心等。急诊24小时应诊，由急救医学专家应诊，并拥有一支训练有素的急救队伍。由于重视人才培养与引进，提倡科技兴医，业务水平日益提高，抢救成功率达90%以上。在心血管内科、内分泌科、腹部外科、肝胆外科、胸外科、耳鼻咽喉科、颅脑外科、小儿新生儿科、血液净化、以及异体骨移植等有极高的声誉，深受病人好评。
---- 香蜜湖分院是一所大专科、小综合的医院，有内、外、妇、儿等科室和医技部门，建立了红斑狼疮、关节炎等专病诊室与病房，开放病床80张，其中风湿科40张。
---- 二门诊部设有内科、外科、妇产科、儿科、中医科、防保科和内分泌等科室，配备放射、B超、心电图室、检验科及中西药房等辅助科室。该门诊部在滨河新村内设滨河社区健康服务中心，为社区居民提供基本的医疗服务。
---- 1. 急救中心
---- 副主任医师以上的专家有5人，博士研究生2人、硕士研究生2人，医护人员50余人，配备有丰田救护车2部。本科成立以来，已进行了多次大型抢救，救治了大量伤员。包括心肺数次骤停病例、重创复合伤、多脏器、功能衰竭、严重中毒、大型工伤事故、集体食物中毒等，为伤者进行心肺骤停复苏、开胸心脏按压、安装临时心内膜起搏器、胸、腹腔闭式引流、自体血回输、气管切开、紧急血液透析等抢救，为争取患者的生命赢得了宝贵的时间。
---- 2. 心血管内科
---- 主任医师2名，副主任医师6名，2名硕士生,心肾疾病研究所还具备较强的科研能力，已承担全国性协作科研1项、省级科研3项、市级科研2项、区级科研3项，部分科研取得价值性成果。全面开展各项心脏介入技术，包括VVI及DDD起搏器（每年15台），最近安装了1台ICD，成为全省第5家能安装ICD的医院。并开展了介入瓣膜成形术、冠脉介入手术等。同时，心肾疾病研究所定期召开病友会，举办健康保健知识讲座，并进行病人随访。
---- 3. 风湿免疫科
---- 副主任医师5人，其中硕士研究生2人，硕士研究生导师1名，聘请主任医师、博士导师2人；风湿科病床40张；创建了全国一流的风湿病实验室，并成立广东医学院深圳风湿病研究所，该所积极开展风湿病的各项研究工作，并将逐步开展包括自身干细胞移植治疗系统性红斑狼疮（SLE），鞘内注射疗法治疗狼疮性脑病，小剂量联合应用免抑制剂治疗SLE，小剂量MTX联合生物制剂应用治疗类风湿关节OO （RA），软骨细胞修复剂应用于RA及骨性关节炎的治疗，中西医结合治疗自身免疫病等各种治疗。该科已成为深圳市风湿病专科的龙头。
---- 4. 肾内科
---- 有副主任医师2人，主治医师2人（博士生、硕士生各1人）；肾内科床位12张，设有肾内科专科门诊和血液透析中心。该科具有丰富的诊治肾内科疾病和抢救危重肾病患者的临床经验，尤其是运用“中西医结合”治疗肾病疗效显著。肾内科开展的新项目包括：肾活检和腹膜透析、血液量子疗法协同红细胞生成素治疗肾性贫血、免疫吸附去脂疗法在家族性高胆固醇血症的治疗、成人泌尿系感染患者IL-13血浆水平及基因表达变化。
---- 5. 消化内科
---- 有主任医师1名，副主任医师2名，开放病床20张，设消化内窥镜室，配有电子胃肠内镜、电子十二指肠镜等先进仪器。对消化道大出血、肝硬化食道静脉曲张破裂、消化道溃疡、返流性食管疾病、肝胆疾病、胰腺炎等消化内科疾病的诊断与治疗积累了丰富的临床经验。开展了食道内支架术、食道静脉曲张套扎术、ERCP等。
---- 6. 普外科
---- 有主任医师2名，副主任医师4名。能进行普外科各种大手术，包括全胃切除术、胃癌根治术、肝癌切除术、肝叶切除术、半肝切除术、高位胆管癌根治术、胰十二指肠切除术、胆囊癌切除术、后腹膜肿瘤切除术、超半肝切除术、肝尾状叶切除术、肝中叶切除术、甲状腺癌颈清扫术、乳癌根治切除术、大肠癌根治术、各种门体分流术（包括冠腔分流、门腔分流等），并开展了腹腔镜下胆囊切除术、阑尾切除术、腹腔镜小儿斜疝修补术、腹部肿瘤介入治疗、晚期肿瘤腹腔化疗、二期手术切除及联合脏器切除等。设在科内的肛肠专科颇具特色。
---- 7. 肛肠科
---- 由杜克义主任主持。在诊断方面，以“指诊眼”特长对肛内直肠确诊肿物性质、分类、以争取患者的治疗时间；在治疗方面，运用中西医结合方法对难治性高位、远端复杂性肛瘘、直肠阴道瘘、环状嵌顿痔等，一次性手术成功治疗脱肛，对术后肛管破坏狭窄进行重建及修复、对婴幼儿肛门直肠阴道血管瘤、无肛症等畸型开展整形分流，传统方法治疗慢性直、结肠炎有显著疗效。
---- 8. 妇产科
---- 主任医师2名，副主任医师7名，硕士研究生2名，开放床位50张。妇科开展了计划生育手术；中西医治疗妇科疾病，包括炎症、陈旧性宫外孕等；不孕症的治疗，包括输卵管宫角植入、输卵管吻合复通术、人工授精等；各种妇科肿瘤根治手术等。产科开展了全产程胎心中央监测、新法剖宫产术、剖宫产术后置留“镇痛仪”（用于缓解病人痛苦）、腹膜外剖宫产术；产房设有爱婴区，保证24小时母婴同室，爱婴病房设有空调、卫生间等。同时，妇产科门诊设有孕妇学校产前检查，参与全市的肝产妇保健系统；门诊开展早孕人流术（11月份开展“无痛人流”）、宫颈息肉摘除术、宫内活检、分段诊断性刮宫、输卵管通液术、微波治疗宫颈炎、外阴、阴道尖锐湿疣、上环、取环术等等。
---- 9. 骨科
---- 主任医师1名，副主任医师4名，其中硕士研究生2人，床位44张。开展各类骨科手术，包括前路颈椎间盘融合术、颈椎前路减压、植骨融合术、颈椎单侧或双侧开门式扩大术、腰椎管侧隐窝扩大开窗减压术、牵引提拉式脊柱滑脱复位术、小开窗腰椎间盘摘除术、股骨与胫骨带锁随内钉固定术、人工股骨头置换术、人工全髋关节置换术、股骨颈低位螺钉固定及滑膜切除术、带血管骨瓣植入治疗股骨头无菌性坏死、胸椎结核、腰椎结核病灶清除术、胸腰椎Harrigton内固定术、胸腰椎Lugue内固定术、椎弓根钉内固定术。同时进行矫形与显微外科手术。其中包括血管、神经、肌腱吻合术、小儿麻痹后遗症矫正术、疤痕松解植生术、断指、断肢再植术、拇指再造术、带蒂，带血管肌生瓣转移术等。同时，率先在深圳市建立了第一个骨库，进行异体骨移植，取得了良好的效果。
---- 10. 儿科
---- 主任医师1名，副主任医师9名，设置病床40张，其中新生儿科病床17张，科室的服务宗旨是：我们尽心，妈妈放心。该科对小儿呼吸系统、消化系统、泌尿系统、血液系统、感染性疾病等常见、多发病，以及儿科疑难病症、急危重症的抢救有着丰富的临床经验。儿科门诊与病房的就医环境温馨、亲切，医护人员身着红色和绿色的工作服，配有儿童游乐设施，定时播放卡通节目。良好的服务，使科室的病床使用率一直保持在90%以上。新生儿专科是医院发展的重点，配有监护仪、呼吸机、开放式辐射抢救台、婴儿培养箱、婴儿高压氧舱、黄疸治疗箱、新手儿转运床等新生儿专用设备，并为家属配备探视系统。目前，新生儿专科在新生儿窒息、新生儿缺氧缺血性脑病、新生儿颅内出血、新生儿呼吸窘迫综合征、新生儿坏死性小肠结肠炎、新生儿败血症、早产儿及极低出生体重儿等的抢救与治疗方面有丰富经验；现在又开展了治疗新生儿动脉导管未闭、新生儿肺出血等症的新项目。
---- 11. 内分泌科
---- 副主任医师2名，博士生2人，设有市内唯一的一个内分泌专科实验室，配备了DPC-Υ计数仪、进口低温离心机等先进仪器。该专科在糖尿病、甲状腺疾病、脑垂体疾病、肾上腺、性腺等内分泌疾病的诊断和治疗上均有较高的水平和良好的声誉。该专科还设立了全市第一家糖尿病教育中心，每月为糖尿病病友及其家属举行两期免费宣传、咨询和教育讲座，建立了糖尿病病人电脑档案，受到广大患者的欢迎和好评。
---- 12. 耳鼻喉科
---- 副主任医师3名，硕士生1名。配有IRY激光、二氧化碳激光、射频治疗仪、微波治疗仪、纤维喉镜、鼻窦内窥镜等仪器；开展耳显微外科、喉显微外科、耳鼻喉恶性肿瘤、鼻神经外科、鼻内窥镜、激光冷冻微波在耳鼻喉科的临床应用等项目。
---- 13. 介入放射
---- 主任医师1名，副主任医师2名。能熟练开展各种介入手术，包括颅内血管、甲状腺血管、肺血管、子宫血管、四肢血管等血管内诊断与治疗技术，还有经皮穿刺肺、肝等诊疗技术，在省内具先进水平。

---- 先进设备
---- 医院拥有1.5T德国西门子高场强超导核磁共振成像系统、美国GE公司的全身螺旋CT、美国红杉树彩色心脏超声诊断仪、全身彩色B超诊断仪、美国GE公司数字减影遥控X光机、大C臂数字减影X光机（DSA）、全身数码拍片X光机、日本、西德血液透析机、瑞典免疫吸附机、美国Acces全自动激光分子免疫分析仪、德国细菌鉴定及药敏测定、全自动分析仪、经颅多普勒、丹麦肌电图诱发电位仪、腹腔镜、胆道镜、胸腔镜、支气管镜、电子胃肠镜、十二指肠镜、输尿管镜、荧光生物显微镜、多套中央监护系统、多台高档自动呼吸机等一大批先进医疗设备。