----医院医疗科室齐全。临床科室有急诊科、内科（含呼吸、消化、肾、血液、内分泌、风湿等6个专科），外科（胃肠胰、血管甲状腺、颅脑、肝胆、烧伤、泌尿、小儿、整形、器官移植、腔镜、SICU等11个专科）、骨科—显微外科医学部（含骨科、显微外科）、心血管医学部（含心内、心外、小儿心内、心脏介入、人工心等5个专科）、妇产科（含妇科、产科、计划生育、生殖医学中心等4个专科）、儿科（含呼吸、肾脏、血液、新生儿等4个专业组）、神经科（含脑血管、遗传、老年性痴呆等3个专业组）、中医科、皮肤性病科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、康复科、麻醉科、针灸科等16个二级学科和33个三级专科，其中肾内科、普外科和神经科等3个学科为国家重点学科，在国内一家医院拥有如此数量的国家级重点学科的医院可谓少之又少。医技科室有影像医学部（含放射科、核医学科、超声科等3个科）、内镜科、药学部、高压氧科、营养部、手术室、输血科、检验医学部、实验医学部等11个科室。广东省器官移植中心、广东省心脑血管病防治办公室、世界卫生组织（WHO）康复中心等社会医疗组织都设在该院。还有华南地区建立最早、规模最大的高压氧仓、规模庞大的血液净化治疗中心和腹膜透析中心、全国规模最大的体外反博治疗中心以及各种重症监护病房，为抢救治疗各种危重病人提供了可靠的的保证。
----目前该院拥有国家重点学科3个、省重点学科4个、中山医“211”工程重点学科3个和院级重点学科3个。器官移植中心、生殖医学中心和骨科—显微外科医学部又成为该院学科建设的新亮点。
----1、肾脏内科
----在我国肾脏病学创始人之一李仕梅教授的亲自创建和指导下，已发展成为集医疗、教学、科研于一体的肾脏病学科。是国家教委重点学科，省“五个一工程”重点专科,有卫生部肾脏病临床研究重点实验室。现有病床120张，血液透析机38台，腹膜透析机2台；有教授12人，副教授13人，讲师、主治医师16人。其中博士导师7人，硕士导师12人。该科在肾病临床研究方面处于国内领先水平，是中华肾脏病学会常委和广东省肾脏病学会主委和副主委单位，主办《中华肾脏病杂志》。专长于：肾小球疾病的治疗尤其是难治性肾综合及狼疮性肾炎的综合治疗；反流性肾病的诊断与治疗；慢性肾功能衰竭的综合防治；腹膜透析治疗，有全国最大的腹透中心；血液透析和肾脏移植，每年治疗血液透析病人约20000人次，肾移植约130—300例次。
----2、神经内科
----神经内科创建于1954年，1974年被卫生部批准为全国神经高级医师进修基地，较早被批准为硕士和博士学位授予点。该科是国家重点学科，是广东省重点学科和省“五个一工程”重点专科，是广东省脑血管病防治办公室、中华医学会神经遗传病学主任委员所在单位，也是华南地区神经疾病会诊中心。现有三个病区，床位90张；教授8人，副教授12人，均有硕士以上学位，其中博士导师5人。该科在神经遗传病（假肥大型肌营养不良症、肝豆状核变性、神经纤维瘤病、腓骨肌萎缩症、舞蹈病、家族性肌萎缩侧索硬化症）、脑血管病、中枢神经系统老年病（帕金森病和Alzheimer病）和中枢神经系统脱髓鞘疾病等神经科领域已经形成了自己独特的医疗特色，在华南地区颇有影响力。1996年以来共获得国内外重大项目基金1558.1万元，获得的2000年国家科技进步二等奖等14项科研成果在全国居领先地位。
----3、胃肠胰外科
----是全国最早从普通外科分出的三级学科，是国内最早经国务院批准的博士点之一，其所在的普通外科是全国重点学科，也是省重点学科和“211工程”重点学科，在临床、教学和科研等方面均具有雄厚的力量。该科是中华医学会外科学分会胃肠外科学组组长单位，主编了我国第一部胃肠外科专著《胃肠外科学》，承办《中华胃肠外科杂志》。多年来，一直主办全国胃肠外科学术会议；每年开办一期国家级继续教育项目，即胃肠外科新技术研讨班。学术梯队完整，学术带头人在国内有较大的影响力，整体水平处于国内领先水平。现有床位42张；教授4人、副教授9人、讲师、主治医师3人，其中博士导师3人。近几年来开展了D4胃癌根治性切除术，结肠J形贮袋肛管吻合术，经骶尾入路的直肠手术，直肠癌全直肠系膜切除术，直肠癌保功能手术等20多项新技术新手术。
----4、血管甲状腺乳腺外科
----有30年的发展历史。该科的发展已处于国内先进水平，其所在的普通外科为全国重点学科。对血管疾病（如主动脉瘤、颈动脉体瘤、动脉闭塞、下肢静脉曲张、深静脉血栓形成、各种血管瘤）；甲状腺、甲状旁腺疾病（如甲亢、甲状腺癌、甲状旁腺肿、甲旁亢和低下）和各种乳腺疾病的诊断和治疗有丰富的经验。现有床位40张；教授4人，副教授5人，讲师、主治医师3人，其中博士导师3人。每年收治病人超过1300例，手术超过1150例，无菌手术切口感染率低至0.19%。现承担有多项国家和省自然科学基金的科研课题，在血管、甲状腺、乳腺疾病基础和临床研究方面取得多项成果。多次获得卫生部和省科技成果奖，主编多部学术专著，在国内外专业期刊发表数百篇学术论文。
----5、肝胆外科
----是集医疗、教学、科研于一体的在国内有一定地位的重点科室，其所在的普通外科为全国重点学科。在该科，我国肝脏外科先驱者之一王成恩教授首先在国内建立了原位规则性肝切除治疗肝癌的技术，获莫斯科国际博览会金奖。该科现有病床46张；教授5人、副教授3人、讲师3人，其中博士导师4人。学科以肝脏肿瘤的诊治为研究重点，承担重大及纵向科研项目10多项，5年来获各种类科研经费合计达150万元，人均科研经费12万元。开展了常温及低温灌注下全肝血流阻断无血切肝术，B超声学造影下无水酒精门静脉栓塞术和术前肝储备功能预测，获国家教育部、卫生部和省科技进步奖8项。收治国内外大量疑难病症，诊治水平达国内先进水平。
----6、微创外科
----微创外科手术将传统手术的拉链式切口变成钮扣式切口，甚至针眼式切口，具有切口小、出血少、内脏干扰少、术后恢复快、住院时间短、病人痛苦少等优点。通常只需切3~4个0.5~1CM大小的切口，甚至更小。大部分病人，上午手术，下午即可下床活动，第2天可以进食，术后3天就拆线出院。
----中山一院微创手术始于1993年，1996年正式成立微创外科，现为全重点学科——普通外科的一个专科。现有床位23张；教授1人，副教授2人，讲师1人。目前大多数的普通外科手术如胆囊切除，胆总管切开取石，阑尾切除，疝修补，结肠癌，食道癌，脾脏切除，手多汗症，纤维胆道镜术后取石及逆行胰胆管造影(ERCP)及乳头肌切开取石（EST）,腹腔探查等均可成功开展。该科成立以来，一直致力推动微创手术在我省、我国的应用与发展，积极为全国及全省培养各类型微创外科人才，在全省及全国有较高知名度。
----7、骨外科
----是省“五个一工程”重点专科，共有床位55张，附设有骨库及诱发电位室；现有教授3人、副教授7人、主治医生4人，其中博士导师1人，具有硕士、博士学位8人。该科在骨肉瘤的基础研究如癌基因表达与预后的关系及多药耐药细胞和耐药基因的表达与逆转、脊髓诱发电位与神经损伤的关系、骨质疏松的发病机制及治疗等方面的研究达到国内领先水平。在脊柱疾病、骨肿瘤、关节疾病、骨折创伤、小儿骨科等方面具有较高的诊治水平，尤其在脊柱外科如脊柱畸形的矫正、颈椎病、腰腿痛的治疗，恶性骨肿瘤保肢治疗提高患者生活质量及生存率，人工关节治疗各种关节疾病等方面已达到国内先进水平。由骨科、放射科与病理科组成的诊断小组，专门解决骨肿瘤疑难病例的诊治问题，在全国独具特色。
----8、显微手外科
----是国内最早成立的同类专业科室之一，一直负责《中华显微外科杂志》的编辑和出版。从70年代的断指、断肢再植开始，到80年代迅速发展，在小血管外科、周围神经外科、淋巴外科、小器官移植手术和小管道手术，特别是臂丛神经损伤和脑瘫的治疗，做了大量的基础研究和临床医疗工作。90年代以来，加强与骨科、五官科、普通外科合作，开展肿瘤切除后的保肢术、舌再造、乳房再造、下颌骨重建和食道重建等手术。现有床位23 张；教授4人、副教授3人、讲师、主治医师3人，其中博士导师1人，教授在国内享有盛名，在显微外科、修复重建外科学会担任重要职务。该科先后完成国家和省、部级科研项目15项，目前在研项目19项，曾获厅级以上科研成果奖13项。
----9、泌尿外科专科
----是省内唯一的泌尿外科博士点。现有床位46张；教授2 人，副教授8人，讲师、主治医师2人，其中博士导师 2 人。医疗优势：普通泌尿外科,腔内泌尿外科（TUPR、气压弹道碎石、后腹腔镜），膀胱肿瘤、肾上腺肿瘤、肾肿瘤、前列腺疾病、男性不育、尿石症的治疗。其中膀胱癌根治性切除可控膀胱术式一直处于国内领先水平；在国内首次开展体外循环肾癌腔静脉癌栓摘除术及肾肿瘤声学造影检查，改良了肾盂癌根治切除术式；肾上腺肿瘤手术突破连续100多例嗜络细胞瘤手术无死亡记录。年均获科研基金5项和科研成果5项以上，近十年已出版泌尿外科专著2部（梅骅教授主编）。
----10、器官移植中心
----是中山大学重点学科和广东省器官移植研究中心的挂靠单位，技术力量雄厚，现有床位40张；教授4人、副教授3人、讲师、主治医师3人，其中博士导师3人、具有博士学位8人。近五年来，已先后承担国家各级科研课题18项，并取得了4项科研成果奖。该中心自1972年成功施行国内首例肾移植以来，迄今已开展肾移植1800多例，肾移植术后1年人/肾存活率为96%/93%，已达到国际先进水平。1993年又在国内首次开展了体外静脉转流下的肝脏移植术，迄今已施行肝脏移植73例。1996年被卫生部批准为国家级肝移植技术培训基地，已举办全国肝移植学习班2次。主编了《肝脏移植的理论与实践》、《临床肝移植》、《移植外科学》及《现代移植学》等4部专著，对促进我国肝移植事业的发展起了积极的推动作用。
----11、消化内科
----消化内科是国内成立较早的消化内专科，现有床位46张，教授2人，副教授7人，讲师和主治医生6人，其中博士导师2人。医疗特色：对原因不明的黄疸、腹水、腹痛和发热等疑难病例积累了丰富的诊疗经验；对幽门螺杆菌及其相关的慢性胃炎及胃、十二指肠溃疡的研究处于国内领先地位；运用多种现代手段治疗慢性肝炎、肝硬化及其并发症；采用综合治疗措施治疗炎症性肠病，大大提高了该类疾病的疗效；拥有多台电子、超声内镜，对胃肠道息肉、消化道出血、胆道结石等进行内镜下的治疗，免除手术之苦；拥有先进的胃肠动力检测设备，能对胃食管返流病、功能性消化不良、肠易激综合征等胃肠动力障碍性疾病进行诊断与治疗。
----12、生殖医学中心
----现有教授博士导师1人，副教授硕士导师1人，具有博士学位的讲师4人。是目前全国最大的生殖医学研究及助孕技术治疗中心，具备稳定、成熟的常规体外受精及胚胎移植（IVF-ET）技术，临床妊娠率达40%，处国内领先水平。已成功分娩试管婴儿600多名。1994年国内首次以激素替代疗法和供卵治疗无卵巢功能的卵巢早衰患者获得成功；1995年在国内首次开展单精子卵胞浆内显微注射（ICSI）获得成功， 1996年10月诞生国内首例第二代试管技术的婴儿，从根本上解决了男性少弱精所致的不育；1997年从睾丸及附睾取精行ICSI获得成功，从而解决了部分无精症患者所致的不孕；同年国内首家开展了胚胎活检术并获得成功，使疾病基因种植前诊断成为可能，并已开始用于临床。2000年5月国内首例第三代试管婴儿又在该科诞生，这是利用先进显微辅助受精与现代分子生物学技术相结合的方法成功完成了人类胚胎植入前遗传学诊断的试管婴儿。

----先进设备
----医院拥有一大批先进的医疗设备，如磁共振成像系统（MRI）、超高速电子束CT（UFCT）、螺旋CT、ECT、颅脑外科手术导航系统、介入放射的数字减影系统、胃肠影像系统、泌尿动态影像分析系统、双向心血管造影机、电脑呼吸功能仪、彩色二维多普勒心功能诊断仪、体外震波碎石机、染色体自动分析仪、彩色超声波诊断仪、彩色经颅多普勒诊断仪（TCD）、电子内镜、无纸脑电图仪、肌电图仪、生理监测仪、全能麻醉机、体外循环机、心肺机、激光治疗系统、流式细胞仪、全自动血球仪及各种生化分析仪器等。还有各种配套齐全、技术先进的内窥镜检查及手术系统，如腹腔镜、宫腔镜、关节镜、膀胱镜、动态喉镜、显微鼻咽镜、鼻窦镜等。